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在目前来说的话，乙型肝炎抗病毒的医治方法根本目的在于持久抑制乙型肝炎病毒复制，延缓疾病进展，降低甚至避免肝硬化、肝癌、肝衰竭及其一并发生的不良症状的发生，让乙型肝炎患病者有较好的生活和生存质量，最终不因慢性乙型肝炎而影响生存时间。
基本目标：检查不到HBV DNA，HBeAg阳性患病者获得血清学转变；
中期目标：肝脏纤维化，甚至肝硬化逆转；
最终目标：预先防范肝细胞癌的发生，增加患病者生存期，降低肝脏失代偿，提高患病者生活质量。
定期重复查：监控治疗效果的必要手段，要持续
慢性乙型肝炎的医治是一个长期过程，而抗病毒药品在每一名患病者身上的效果并不一样，因此对治疗效果的监控是非常有必要的。医生能够根据患病者治疗效果的好坏，对下一步医治进行调整。
不管选用何种药品医治，肝功能、HBV DNA定量、“乙型肝炎两对半”、甲胎蛋白是必查的项目。在此基础上，根据所用的药品不同，再对其他指标进行监控。
擅自减药：更易诱发耐受药物，别任性
慢性乙型肝炎需要长期医治。当长期持续使用药起到作用时，怎样停药又成为乙型肝炎医治的另一个难题。
有些患病者在取得治疗效果后就想减量服药，这样的观点是不正确的。目前，核苷（酸）类药品的半衰期在12小时左右，服用方法都是一天一次。如果用一天药再停药一天，就会导致治疗效果减少。我们“松一松”，病毒“攻一攻”，病毒适应后，耐受药物机遇就会增多。也就是说，减量使用药不但起不到医治作用，而且会诱发耐受药物，给医治带来困难，给患病者延长经济负担。因此，抗病毒医治应保证足够使用药疗程，在专业医生指南下停药并随访监控，这样不仅安全，再医治的话也不容易出现耐受药物。
虽然目前应用最多的口服抗病毒药品还不能根治病毒，需要长期使用药，但是科技发展日新月异，根治乙型肝炎的特效药早晚会出现，先把现有药品用好，为未来医治争取时间，能说不重要吗？
特别情况：医治前应筛查乙型肝炎相关指标，避免肝损
化学疗法或免疫抑制剂医治会使患病者免疫力减少，使乙型肝炎病毒大量复制而引发起肝脏损害，甚至出现严重的纤维淤胆型肝炎。如果乙型肝炎病毒感染者因其他疾病（如肿瘤或自身免疫性疾病等）需要接受化学疗法、免疫抑制剂医治，一定要在医治前筛查乙型肝炎相关指标，根据详细情况决定是否需要加用抗病毒药品。
因乙型肝炎多需长期医治，药品价钱及医治费用是患病者必须面对的问题，不少患病者因此难以维持医治。政府正通过一系列措施减少相关费用。例如，通过国家药物谈判，一线抗病毒药品替诺福韦酯价钱已减少一半以上；越来越多的省市把抗病毒药品纳入医保报销范围，个人承受比例显著减少；B超、CT、核磁共振等检测费用逐渐下降。
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